si en la F1 solo aparecía el carácter de un progenitor entonces, ¿qué sucedía con el carácter del otro progenitor que no aparecía en esta primera descendencia? Mendel permitió la autopolinización de F1 y observó que en la nueva descendencia, o F2, reaparecían los caracteres que no eran visibles en la F1. Así, al obtener la F2 en su jardín nuevamente había plantas de arveja con semillas amarillas y con semillas verdes.
Mendel supuso que, para cada carácter, la planta poseía un par de factores responsables de la herencia, cada uno de ellos transmitido por una de las plantas progenitoras. A cada uno de estos factores los categorizó llamándolos dominantes cuando siempre se manifestaban en la F1, como ocurríá con el color amarillo de la semilla, y recesivos cuando no parecían en F1 sino que solo se manifestaban en la F2, tal es el caso del color verde de semilla. Cada factor se puede simbolizar por una letra, mayuscula si es dominante, y minúscula si es recesivo.